Stellen Sie den Wacholder das ganze Jahr über im Freien an einen sonnigen Ort. Manche Leute stellen es ins Haus, aber tun Sie das nicht, sonst stirbt der Bonsai ab. Schützen Sie es im Winter bei -10 °C. Einige verfärben sich als Frostschutz violettbraun und werden im Frühjahr wieder grün.

Geben Sie dem Wacholder nicht viel Wasser, das mag er nicht und kann auf Dauer zu Wurzelfäule führen. Warten Sie, bis die Erde ausgetrocknet ist, bevor Sie sie gießen. Sprühen ist häufig erlaubt, insbesondere nach dem Umtopfen wegen Feuchtigkeit.

Während der Vegetationsperiode monatlich mit festem organischem Dünger oder wöchentlich mit Flüssigdünger düngen. Wählen Sie für ein schnelles Wachstum einen Dünger mit mehr Stickstoff.

Schneiden Sie während der Vegetationsperiode lange Triebe mit einer scharfen Schere ab. Tun Sie dies so nah wie möglich am Stamm/Ast.
Beschneiden Sie den Wacholder nicht wie eine Hecke, da dies zu einer Bräunung führen und den Wacholder schwächen kann. Der Wacholder ist stark, kann aber ohne seine Blätter nicht überleben. Lassen Sie also etwas Laub an den Zweigen.

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Alle zwei Jahre umtopfen, ältere Bäume sollten seltener umgetopft werden. Wählen Sie einen gut durchlässigen Boden, wie z. B. Amaka, und seien Sie vorsichtig beim Beschneiden der Wurzeln.

Wacholderbeeren sind von Natur aus resistent gegen Krankheiten und Schädlinge, Sie müssen jedoch verhindern, dass sich Schädlinge in zu dichtem Laub verstecken. Kontrollieren Sie sie im Winter sorgfältig, denn dann können auch Schädlinge auftreten. Sie sind anfällig für Spinnmilben, Schildläuse, Blattläuse und Wacholdermotten. Verwenden Sie Insektizide und lokalisieren Sie die Kontaminationsquelle. Beachten Sie, dass Birnenrost je nach Art unterschiedlich empfindlich darauf reagiert. Blaugrüne Wacholderbeeren sind meist widerstandsfähiger als gelbgrüne. Japanische Sorten bekommen selten Birnenrost, der zu dauerhaften Schwellungen und braunen Gallen führt. Der Pilz breitet sich auf Birnbäume aus und verursacht braune Flecken. Wacholderbeeren heilen den Birnenrost oft nicht. Befallene Wacholderbeeren verbrennen oder wegwerfen; Aufgrund der Resistenz und Kontaminationsgefahr der Sporen kommt eine Kompostierung nicht in Frage.